1.崇拜學 (禮拜學)
研究公眾禮拜之本質與禮拜儀式在歷史上的變遷，所表現出來基督徒共同生活，現代教會禮拜所面臨的問題探討，台灣基督教會目前如何把禮拜儀式本地化，解說教會公眾禮拜的聖禮儀式。
2.音樂概論（樂理、司琴法、指揮、聖樂….）
本課程：基礎樂理、基本指揮法、注重聖樂有關知識….基督徒若不懂音樂，這真的是太可惜了！因為音樂在上帝的國度，都是永存的榮耀與侍奉！讓我們懂基本樂理、懂得唱歌、懂得一些樂器，運用教會崇拜、宣教等事工上，使我們成為合神心意，榮耀、敬拜上帝的兒女。
3.門徒訓練
門徒訓練課程目的是要不斷操練自己成為主的門徒，行在 神的話語中，與信徒交通，向世人作見證，服事人，並以此去訓練傳道人如何去栽培他人。
4.教會行政與事工
（1） 探討牧者應具的異象、使命及扮演的角色。訓練同工培養恩賜，發展服事的平衡。認識教會組織及型態，熟悉教會組織與法規的運作。
（2） 研究教會事工計劃、組織、協調、輔導、評估以達傳道、牧養、服務之目的。
5.教牧諮商輔導（教牧協談）
在硏究牧會神學與其他神學部門及行為之關係。探討牧會關顧的目標和意義。介紹各種牧會協談的類型，方法論及其與比較（理）治療之關係。藉個案硏究（Case Study）來透視專家們對個案的分析與協談的技術。
6.教牧諮商個案研究
在面對不同個案問題的時候，在教會生活中，不單單是傳道人要知道，也必須是每一個基督徒都應當有所裝備的課程。我們不是使用非教會教義為基礎的諮商法，而是以聖經真理為根基的教牧諮商成為對個案的幫助！
7.教牧學
硏討宣道牧會的本質與神學之關係及牧師的本份與職責。傳道者不只是個講道者、牧者，更是一個領導者，行政管理者，面對世俗又多元化的社會，透過專題與個案硏討有助於瞭解如何採取有效策略。
8.宣教學（概論）
（1）研究宣教之聖經根據，幫助學生面對今日世界宣教責任，並該如何裝備自己。
（2）在探討舊約中上帝子民的歷史和宣教使命，新約中耶穌的降生、事工、受難、死、復活，而建立的救贖普世契約，以至於教會之建立以及「使萬民做門徒」的宣教運動之開端。
9.宣教實習
當我們有神學院的宣教課程裝備之後，我們也盼望神學生有宣教實習的機會，無論是台灣各地，或是大陸、海外，讓我們可以將所學的理論，轉化成為宣教禾場上有效的運用！
10.講道學/法
認識講道在事奉中的重要性，並介紹講道學的主要概念，建立對講道的基本認識，學習如何寫作講章和實際傳講，並認識主要神學訓練與講道的關連，以及改革宗傳統下的講道傳統。（※修此課時要先修釋義。）
11.本土宗教認識
本課程宗旨：在研究歷史上台灣所有宗教，從原住民宗教、民間宗教、基督宗教、儒教、道教、佛教、回教，以至於新興宗教，作一個概要介紹，大概瞭解台灣諸宗教發展的輪廓，作為從事傳教事工的心理準備。
12.佈道學/法（佈道法與實習）
在信仰的傳揚上，我們不能只是拿著聖經講，當然聖經是 神的話，但上帝已賜下智慧、能力與口才給我們，方法萬變，真理不便！使我們能夠在各樣景況中，無論得時不得時，我們都可以有效的傳福音，也讓我們經歷福音的大能！
13.研究方法與論文寫作
學習基本的硏究方法與讀書態度，認識神學教育的精神目標，建立基本神學研究工具書目，並且以分享的方式針對實際寫作論文與硏究報告，並提出問題討論。
14.畢業論文
透過神學性論文的完成，可以幫助神學生有效的邏輯思維掌握與神學觀點清楚有效的傳遞，不單在深度與廣度上都有一定的表達，更可以帶動往後處理神學與做學問的基礎！
15.畢業講道（講道之操練）
（1）在於培養同學成為一位能講道的人，忠實解釋經文，合宜地撰情境化正確講章的講章，擬訂清楚的焦點和開端，以熱情與真實傳講上帝的話。此外，上課同學必需參與畢業講道之討論及提出建議。
（2）透過畢業講道，可以讓神學生把多年所學的神學做個整理與應用，更可以在講道的操練中知道如何透過教會講台的證道，成為弟兄姊妹的幫助。